王闿运一直对曾国藩没有能接纳他的建议感到可惜，事隔多年，王闿运曾对他的门生杨钧讲起这件事，他说："曾大帅功高望重，将士用命，他何不乘机夺取江山，自立为帝呢？何苦白替他人卖力？"他说，当时曾国藩在听王闿运的策略时，一语不发，只是在书案的纸上写着："妄""谬"。
咸丰十一年（1861年），王闿运还建议曾国藩自请入京，阻止慈禧太后垂帘听政，避免后宫干政。而曾国藩是个谨慎的人，当然不会采纳王闿运的建议。
其实，王闿运虽精通"春秋公羊学"，谙熟纵横家学说，但他不了解时局，晚清已不是战国时代，不是纵横家发挥才能的时候了，没有列国纷争，只有一个腐朽但仍极力在维护专制集权的顽固力量在垂死挣扎。"辛酉政变"肃顺等八位"顾命大臣"被诛杀了，慈禧垂帘听政，独揽朝中大权。清王朝垂而不死，曾国藩所统帅的湘军，虽力量不弱，但也不敢造次，别说他有忠君思想，有"道统"观念，就是他真的举起反清旗帜，也仍很难真正成功。
王闿运虽然一直在为曾国藩感到遗憾，他当时的现实局势，也很难证明王闿运的策略是对的。
光绪元年（1875），曾国藩长子曾纪泽知道王闿运才识非凡、史学渊博，且对湘军很熟悉，于是，请他主修《湘军志》。王闿运真的把这事揽下了。他用了两年时间走访调查湘军事迹，并想办法借阅了军机处的大量档案，他还仔细阅读了曾国藩的日记，请人制作了湘军与太平军作战的地图，最后，他完成了十一万字的《湘军志》。而这一部专史，被后代学者称为是"文笔高朗，为我国近千年来杂史中第一声色文学。"认为该书"是非之公，推唐后良史第一"。
