有一个很典型的例子可以说明王闿运与曾国藩的主张是大不一样的。
之前，曾国藩对王闿运还是很欣赏的，咸丰三年（1854年），曾国藩开始举办团练，王闿运曾写信给他，提出了一些好建议，受到了曾国藩的赞许和接纳。后来，曾国藩幕府中不少人被提拔而升官，而王闿运却没有能升官，这可能与曾国藩对他的纵横思想有些担心有关，担心若王闿运进入官场，会惹出一些麻烦，加上之前王闿运的肃府经历，这是当时官场所忌讳的。
1858年11月，湘军在三河镇被太平军击败，曾国藩非常悲观消沉，而王闿运急忙赶到曾国藩驻扎的江西建昌，陪着曾国藩，伴着他共度艰难时期，与曾国藩两次密谈至三更时分。
后来，在曾国藩指挥下，湘军不断强大，成了当时清政府唯一可以与太平军抗衡的军事力量。王闿运精通春秋公羊之学，谙熟纵横家学说，有"改制"思想，敢于"变易"，对古代的"帝王之学"也颇有研究，他知道历史上开国帝王纵横捭阖的策略。
有这样一种纵横理念，他结合当时的政治军事局势，对于清廷、湘军与太平军矛盾状态和发展趋势是有比较深入的了解的。
