随着北方逐渐回到了朝廷手里（尽管只是名义上），孛罗和扩廓的矛盾逐渐激化。孛罗想凭借山西大都督兵农司使的身份拿到扩廓势力范围内的粮草，最好是取而代之；而扩廓也对这个老奸巨猾的邻居心怀警惕乃至敌视。二人就对山西的控制权展开激烈争夺。1363年扩廓占了上风，孛罗败退京城，顺势掌控了京师。爱猷识理达腊对孛罗心存忌惮，他决定离开京城并向敌人的敌人扩廓寻求保护。
孛罗可能有些过火了，他的步步紧逼和对太子掩藏不住的敌意终于促使皇帝下定决心。1365年，孛罗在路上被乱斧砍死。扩廓受命护送太子爱猷识理达腊返回京城，他被恰如其分地封为河南王，并被派去从起义军手里夺回长江中下游地区。尽管在整个华北，即使算上皇帝，再也没有可以与之匹敌的势力，扩廓仍然不打算作进一步的图谋。比起养父察罕，扩廓对元廷的效忠似乎更多的是发自真心。他选择当好自己的河南王，并将整个华北作为自己的根据地而加以巩固。
据说太子被孛罗吓得跑到太原时，准备效仿灵武故事，自立为帝。他寻求扩廓的支持，但扩廓根本无意政变。扩廓护送太子回京后，奇皇后又派人来游说扩廓，要他拥护太子进宫，把老皇帝赶下皇座，扩廓自然不答应。自此，太子母子对扩廓谈不上什么好感。朝中的大臣也因为扩廓出身并非根脚官人（即世袭贵族），多少有些轻视他。皇帝对这个手握重兵的将军也很忌惮，巴不得他赶紧离开京城。种种这些宫廷特有的勾心斗角，都让扩廓在宫里颇不自在。前面说过，比起朝堂文治，扩廓更向往金戈铁马的军营生活。
扩廓奉命代太子南征，一开始他表现得很积极，但之后的几年里扩廓的心思却放在内战上，无暇南顾。
