关于朝廷应对，《国榷》十二月初四日："初，召逮崇焕时，大学士成基命睨大寿心悸状，因顿首请慎重者再，敌在城下，非他时比。"《明史》251《成基命传》综述其事："袁崇焕、祖大寿入卫，帝召见平台，执崇焕属吏，大寿在旁股栗。基命独叩头请慎重者再。帝曰：'慎重即因循，何益？'基命复叩头曰：'敌在城下，非他时比。'帝终不省。大寿至军，即拥众东溃。帝忧之甚。基命曰：'令崇焕作手札招之，当归命也。'时兵事孔棘，基命数建白，皆允行。"《国榷》系基命建白事于初六日丙辰，"又条上规画。上俱从之"。大约崇祯已感觉不妙，一时惶惶不知所出，惟基命之言是听，但不肯认错。《国榷》同日，传谕通州之孙承宗："朕以东事付袁崇焕，乃胡骑狂逞。崇焕身任督师，不先行侦防，致深入内地。虽兼程赴援，又钳制将士，坐视淫掠，功罪难掩。暂解任听勘。祖大寿、何可纲、张弘谟等，血战勇敢可嘉。前在平台面谕，已明令机有别乘，军有妙用。今乃轻信讹言，仓皇惊扰。亟宜憬省自效，或邀贼归路，或直捣巢穴，但奋勇图功，事平论叙。夫关宁兵将，乃朕竭天下财力培养训成，又卿旧日部曲。可速遣官宣布朕意，仍星驰抵关，便宜安辑。"《孙承宗行状》录此谕文字略同，之前有"遂命公移镇关门"，则承宗由通州赴关门在初六日。谕中不再是"言之不甚悼恨"，而是"功罪难掩，暂解事权听勘"一语，即崇祯得知关宁兵东溃，隐约发觉逮系崇焕铸成大错，亟需安抚关宁兵祖大寿等人之措辞。
成基命从中斡旋，奏请以袁崇焕手札招大寿事，钱谦益《孙承宗行状》及《有学集》卷34《成基命神道碑》俱不载。《行状》详载承宗之处置，大体出自承宗奏疏。《行状》继云："公惧大寿之果与奴合也，大书榜示军前：'东奴久薄近郊，急调祖大寿兵往遵化捣巢，遏虏归路，用以疑虏。'传檄谕大寿及诸将曰：'今日东兵（即指关宁兵）西还，必无一毫罪戾。'又密札谕大寿，教以急上疏自列，束兵杀贼以报浩荡之恩，以赎督师（崇焕）之罪，而仍许代为别白。大寿得帖子大哭，诸将亦哭，乃具如公指还报"云云。似安关宁兵于反侧，一出于承宗只手回天。而据崇焕军中职方郎中余大成《剖肝录》，实另有隐情，移录于下：
焕自蓟趋京，两日夜行三百里，所部马兵才九千人。广渠门一战，挫之，意俟步兵至，方合力逐北。而初一日之命下矣。
诸廷臣持焕者十之三，而心悯其冤者十之七，特以所坐甚大，且惮于（温）体仁与（梁成）栋，未敢救。石衲（当为余大成号）时任职方，独发愤对众曰："奈何使功高劳苦之臣，蒙不白之冤乎！"栋曰："此上意也。"石衲曰："焕非惟无罪，实有大功。今日围城中，舍此谁堪御敌者？朝廷置兵部官何用？使功罪倒衡若此，公宜率合部争之。"栋曰："人皆言焕畜逆。"衲曰："兵由蓟入，焕自辽来，闻报入援，誓死力战，不知所逆何事？所畜何谋也？"（中略）栋时声色俱厉，（中略）不怿而退。
次日初二，衲又往见栋，曰："敌势甚炽，辽兵无主，不败即溃耳。莫若出崇焕，以系军心，责之驱逐出境自赎。既可以夺深入者之魄，又可以存辽左之兵。公为国大臣，当从国家起见，万无从嫌隙起见也。"栋曰："辽兵有祖大寿在，岂遂溃哉？"石衲曰："乌有巢倾鸟覆而雏能独存者乎？大寿武人，决不从廷尉望山头矣。"栋时以其语闻之朝房。辅臣周延儒问曰："公虑祖大寿反耶？"石衲曰："然。"儒曰："迟速？"石衲曰："不出三日。"儒曰："何也？"石衲曰："焕始就狱，寿初意其必释。今日则庶几有申救而出之者。至三日，则知上意真不可回，而廷议果欲杀焕矣。寿与焕功罪惟均者也。焕执，而寿能已耶？不反何待？"儒点头曰："奈何？"体仁曰："不然！寿若与焕谋，即合敌耳；否则，必杀敌。反将安之？"
