1369年西察合台汗国实际上亡于帖木儿帝国，至1402年西察合台汗国正式灭亡。而东察合台汗国则于1514年被叶尔羌汗国所灭。
不过叶尔羌汗国君主也是察合台的后裔，只不过改了个国号。1680年叶尔羌汗国为准噶尔汗国所灭，察合台汗国正式灭亡。
虽然察合台汗国是五个国家中最后一个灭亡的，但察合台汗国并不是成吉思汗子孙所建立的政权中，最后一个灭亡的国家。从金帐汗国中分裂出来的克里米亚汗国才是最后一个由成吉思汗子孙建立的国家，其于1783年被沙俄所灭。
（克里米亚汗国位于今天的乌克兰南部）
除此之外，帖木儿帝国、准噶尔帝国、莫卧儿帝国也都是蒙古人建立的，但这些国家君主并不是成吉思汗后裔。
当然，其实从某种意义上来讲，今天的蒙古国虽然是一个共和国，但依然属于成吉思汗创建的。因为在成吉思汗出现之前，蒙古这个民族和国家都是不存在的。所以，成吉思汗所创建的诸多国家中，今天还有蒙古国存在于世。
