1480年，金帐汗国大汗阿合马出兵进攻莫斯科公国失败被杀，金帐汗国从此失去了对俄罗斯人的控制。1502年，末代大汗赛克赫阿里被克里米亚汗国击败，钦察汗国灭亡。
（金帐汗国版图）
第四个灭亡的是大元帝国。元末因吏治腐败，民族压迫严重，爆发了著名的红巾军起义。而此时元廷内部仍旧是内斗不断，导致元朝错过了镇压起义军的最佳时机。1368年，明军大将徐达攻占元大都，元顺帝北逃，元朝在中原的统治宣告结束。
此后元朝的统治范围重新退回蒙古高原，但仍旧使用"大元"国号，史称"北元"。1402年阿里不哥后裔鬼力赤杀死北元第七位大汗坤帖木儿，不再使用"大元"国号，大元帝国正式成为历史。不过大元的灭亡并不意味着大蒙古帝国的灭亡，只不过蒙古帝国不再使用大元国号罢了。
