明朝的这些海防措施，可谓有利有弊。利在统治者，利在国防；弊在老百姓，弊在民生。明朝确立海禁加强军备，其实主要目的并不是针对倭寇，而是防止老百姓下海。
明朝的海禁和海防，主要是'禁"本国居民私自下海，出洋经商，"防"内外勾结，贩卖番货，扰乱治安。朝廷颁布了海禁政策，老百姓就不下海经商、捕鱼、煮盐了么？当然不会。因为在当时做海上生意，虽然很辛苦，但获得的收入也很丰厚，显然要比在家乡种地划算，所以尽管有海禁，仍然趋之若骛。不但有许多边民偷偷下海，而且还官商勾结，海禁政策执行的时紧时松，并非总是很严厉。例如在福建的兴化卫，指挥使李兴、李春曾私自遣送商贾下海做生意，回来后坐地分钱。
明朝的海禁政策原本是要强化内部控制，割断与外界的联系，但到最后，沿海的军人都参与下海经商，这不能不引起朱元璋的高度警觉。在沿海地区出现了倭寇骚扰也不算什么，这些日本强盗来到中国，人地生疏，两眼一抹黑，但如果有内贼接应，隐患就大多了。对明朝政府来说，最大的忧患还是在海禁政策的影响下，出现的内外勾结现象。
