高昌回鹘，留下了大量辉煌灿烂的文物，但却没有留下一本简单的编年史，所以今天的我们对高昌回鹘建立的年代，统治者的世系都不清楚，只在《辽史》和《宋史》中有一些只字片语的记载。许多人常常会说西夏缺乏史料的记载，其实高昌回鹘王国的历史对于今天的我们来说更是扑朔迷离。
公元1125年，耶律大石建立西辽之后，高昌回鹘同样成为了西辽的附属国。
而历史进入公元13世纪，随着西辽的率领和蒙古人的崛起，高昌回鹘最终归降了蒙古人，时间大约在公元1211年。
这一年，高昌回鹘的首领巴而术·阿而忒朝见成吉思汗，成吉思汗十分看重他，将其排在术赤、察合台、窝阔台、拖雷之后，成为了自己的"第五子"。后来，巴而术·阿而忒战功卓著，其所在的高昌回鹘王国作为一个附庸国保存了下来，甚至被称为蒙古的"第五汗国"。
