东林党人
但在明神宗还在位的时候，曾因立太子一事引发过一场史称"国本之争"的争执。神宗不喜宫女所生的皇子朱常洛，偏宠郑贵妃之子朱长洵，更有要立其为太子的意愿。朝廷一时间混乱不堪。最终虽以东林党人支持的朱常洛顺利成为太子告终，但东林党人仍心存芥蒂，在推举南明新皇时并未选择朱长洵之子朱由菘，而是以立贤为由拥立神宗胞弟之子朱常芳。
但同时又有人主张立贤也要立亲，拥立神宗七子朱常瀛。新王候选人实在太多，各方又争执不下，虽然最后朱长洵成功继位，但拥立何人为帝还是在大家心里种下了一根倒刺，始终无法真正一心。后来"大悲案"、"太子案"、"童妃案"三大疑案的发生，更是让本就如浮萍般飘摇的人心更加脆弱，甚至彻底瓦解，造就了弘光皇帝仅在位一年就被俘获的结局。
敌我态势不清
南宋时期的格局从地图上就能很清晰的看出。南宋南渡后，偏安江南，占据东南部地区，除东南沿海之外，被少数民族番邦政权包围。北方是虎视眈眈的金，西北是西夏以及更加靠北的虎视眈眈的蒙古。南宋纵使军事力量有限，可经济的繁荣对其他国家而言仍是一块不可多得的肥肉。表面看南宋可以说是四面楚歌，退无可退，但当这三个国家都有吞并南宋然后独自称大的想法时，势必就会产生利益上的冲突。
