而为《奥本海默》辩护的一方，则指出日本在二战中其实是施害者，原子弹是对日本战争罪行的惩罚。但如果再往深处挖掘历史，又有人质疑，既然应该惩罚日本的战争罪行，那为什么美国赦免了日本731部队负责人石井四郎？而731部队的那些人体实验资料后来去哪了？当年以石井四郎为首的、从事人体实验的军医，在战后都没有受到惩罚，有的去了医药机构，有的去了大学医学院。731部队的人体实验资料则全部被移送到美国，至今未能公开。
1954年4月，奥本海默出席美国原子能委员会安全听证会
这是一个非常严肃的问题，对于战争罪行的追责，到底要采用什么样的方式？
如果要追问南京大屠杀、追问慰安妇等等问题，那么要不要追问原子弹和东京轰炸？要不要追问赦免石井四郎等战犯以换取731部队的人体实验数据的行为？
这些问题实际上是连在一起的。正是在这个意义上，远东国际军事法庭的审判是很不彻底的。比如，像岸信介这样的甲级战犯也没有受到惩罚（只因为他跟东条英机是政敌），美国后来还让他当上日本首相，其家族影响力一直延续到他的外孙安倍晋三。
二战后，遏制苏联和中国的冷战需求主导了美国的东亚政策。朝鲜战争爆发后，美国的对日政策立刻转向，从打压财阀变成扶植旧财阀、支持反共亲美的右翼政客，相当于把二战"余孽"又重新扶植为政界和经济界领袖。
如果我们把抗日战争理解为殖民和反殖民、帝国主义和反帝国主义的斗争，那么二战结束后，日本以及受到日本侵害的地区应该开启去殖民化、去帝国主义化的进程。但这个任务因为冷战的兴起而没有完成。
所以，我常说冷战在朝鲜半岛还没结束，其实岂止是冷战没有结束，连太平洋战争都没有彻底"结束"，二战遗产没有得到应有的清算。战后东亚就这样被拖入了以美国为主导的所谓"自由世界"和"共产主义"对立的格局，导致后来对历史问题的认知、理解和批判日益错位。
从这一点看，其实《奥本海默》的反思还是比较深刻的：电影对原子弹的批判恰恰和1995年美国进步派历史学者有极大共鸣。奥本海默在政治立场上偏左翼，曾经跟美国共产党走得很近，战后遭到麦卡锡主义的迫害。这部电影有效展示出，美国官方对二战及原子弹的态度，和它的反共意识形态和冷战叙事之间，有着深刻的关联。
