再者，毒杀说也跟情理不合。戊戌政变后，光绪帝处于慈禧的幽禁之中达十年之久，按说慈禧随时可以将他置于死地，既然光绪帝此时已病入膏肓，不过拖时间而已，慈禧还有必要做这种良心泯灭、天理难容的勾当吗？至于慈禧怕自己死后光绪帝翻案的判断也难令人信服，新统治者上台后重翻前朝旧案本是中国古代政治的常规，并不足怪。对年迈的统治者来说，可怕的是死，而不是死后被翻案，既然两眼一闭，撒手西归，还管谁如何翻案？况且慈禧立溥仪为帝、命载沣摄政的时候，特意强调"所有军国政事，悉秉承予之训示裁度施行"，可见慈禧尚未想到自己的生命也临近终点，就更没必要将光绪置于死地了。
有学者对"检测报告"提出了商榷。无疑，光绪遗体早已腐化，科学家提供的是现在附着在遗骨、遗物上的砷含量，能多大程度上说明当时光绪身体里的砷含量呢？光绪帝的陵寝曾被盗掘，地宫环境和遗体惨遭破坏，又经文物部门的清理，几十年之后，还具备检测的条件吗？
笔者并非断定光绪帝肯定是正常死亡，也不抹杀学者们研究成果的价值，而是认为光绪之死的一些环节尚未得到完全的揭示，其死亡的真相可能在今后的研究中得到最终的证实，也可能永远是一个谜团。史学家没有能力，也不奢望揭示出所有的历史真相，这或许也是历史学的魅力所在吧。
据太监回忆，慈禧得知光绪帝病危，曾哭着说："他的后事多未准备，他还没有地呢！"这指的是光绪生前未营建陵寝。其实，慈禧流下的是鳄鱼的眼泪，不论光绪到底死于什么原因，都是慈禧迫害的结果。他一生三十八岁，在位三十四年，自打记事起就君临天下，但始终生活在慈禧的阴影之下，不仅没有体验过君主的威严和权势，也没过几天舒心的日子，备受控制、摧残和折磨。尤其是戊戌政变后被长期幽禁，生死难料，命运莫测，正值奋发有为的壮年就撒手人寰，令人扼腕叹息。光绪无子无女，在某种程度上甚至可以说连家室都没有，命运的悲惨超乎常人想象。
坎坷命运，盖棺史评
从帝王的角度来看，光绪皇帝无疑是个失败者，他的失败源自慈禧太后的迫害，但换个角度来看，也可以说他没有处理好跟慈禧太后的关系。其实，他的生父醇亲王奕譞和叔叔恭亲王奕对他都有告诫。奕临终上遗折指出："伏愿我皇上敬天法祖，保泰持盈，首重尊养慈闱，以隆圣治。"光绪帝若能做到这一点的话，对王朝命运和自己的境遇来说，都可以避免很多悲剧。
针对光绪皇帝与慈禧太后的矛盾，在晚清担任过御史的胡思敬说过这样一句沉痛的话："自古国家之败多起于伦理，家齐而后国治。"这道出了母子矛盾对王朝命运的深远影响。由于矛盾的一方是掌握中国命运的慈禧皇太后，另一方是万乘之尊的光绪皇帝，这二人的矛盾绝非家务之争那样简单，说到底还是权力分配的问题。换句话说，他们之间的一切矛盾都可以归结到这一点--光绪要权，而慈禧不放权。
众所周知，在中国古代女子没有政治权利，慈禧太后把持国家政权缺乏合法依据。此前慈禧垂帘听政，前提是皇帝幼小，她以儿子监护人的身份代行皇权，是一种临时和权宜的办法。等孩子成了大人，能够按照自己的意志独立行事的时候，就不需要母亲的监护了，垂帘听政自然就要结束，慈禧并不否认这一点。
