光绪名为皇帝，但并不能享受很好的医疗条件。当时，给皇帝治病的医生不少，众所周知，中医跟西医不同，每个医生都有自己的治疗方案，有的强调"补"，有的强调"泄"，有的使用寒性药材，有的使用温性药材，医生几天一换，治疗也时断时续，不成系统。再加上光绪帝警惕性很高，往往不吃太监端来的汤药，这样一来，自然收不到什么效果。
提起光绪帝的病情，还必须考虑到精神因素。他一生感情失落，政治失意，心情压抑。尤其是戊戌政变以来，他处于被软禁状态，备受凌辱和虐待，孤立无助，坐以待毙，担惊受怕，珍妃之死的消息也足以令他精神崩溃，这样一来，就没有康复的希望了。
据清宫脉案记载，从光绪三十四年(1908)初夏起，光绪帝病情迅速恶化，御医和全国各地应召前来的名医均感束手无策，只能不求有功但求无过地敷衍着。这年的九月中旬，达赖喇嘛从西藏来到北京，光绪帝拖着病弱的身体，连续接见、宴请，为此劳累过度。这时候慈禧也病倒了，她患的是腹泻，已经治疗了一段时间，未见明显起色，但一开始御医并未过于悲观。
挨过了十月初十日慈禧太后的生日，光绪帝身体机能迅速衰竭，病入膏肓。他自述有便秘、咳喘、腿酸、失眠、发热、身痛等症状。十六日，光绪帝跟慈禧太后最后一次召见大臣，他有气无力地斜倚在宝座上，身后垫满了枕头。据大臣回忆，光绪帝说话声音极小，只有简短的几句，慈禧也是一脸病态。从此，光绪帝再没有离开病榻，十九日起，已经不进食了，很快陷入昏迷。据清政府官方宣布：光绪三十四年十月二十一日(1908年11月14日)傍晚，光绪皇帝在中南海瀛台的涵元殿逝世，终年三十八岁。
据《清德宗实录》记载，在光绪帝逝世的前一天，慈禧授予光绪帝同父异母弟弟醇亲王载沣"摄政王"的职位，将他的长子溥仪接到宫中教养。光绪帝咽气后，慈禧立即宣布：溥仪继承同治皇帝，兼祧光绪皇帝，为清朝新一代君主。又规定："嗣皇帝尚在冲龄，正宜专心典学。着摄政王载沣为监国，所有军国政事，悉秉承予之训示裁度施行。"这表明溥仪为帝，载沣摄政。实际上他们全是慈禧的傀儡，清朝的命脉还是掌握在慈禧手中。可见，直到此时慈禧不仅对自己的生命力依然乐观，权力欲也没有丝毫的衰减。
然而，在慈禧做出这一系列决定的第二天，她就走到了自己生命的尽头。光绪三十四年十月二十二日午后，慈禧太后去世，终年七十四岁。
噩耗公布，天下震动。为什么年轻的光绪反而死在了慈禧之前？而且，母子二人相差不过二十个小时相继去世，世界上有这么蹊跷的事儿吗？事情的真相到底是怎样的呢？
光绪的葬礼
清史疑案，死因为何
