六年后的至元二十一年（1284年），宰相桑哥受贿被治罪，杨琏真伽受牵连被抄家，官员抄出宋理宗头颅制成的"嘎巴拉碗"，送到了宣政院，此后被皇帝赏赐给帝师。
明太祖朱元璋灭掉元朝后，有一次举行宴会，大臣危素说起了杨琏真伽盗掘宋六陵的往事。
明太祖叹息良久，诏命北平（金属北京）守将从西僧汝纳手中，买回了宋理宗头骨制作的酒器，令有司官员将头骨安置在高坐寺西北。
第二年，绍兴官员把永穆陵图进献朝廷，明太祖再度下诏，将宋理宗头骨葬入故陵。
《殊域周咨录》记载：明太祖朱元璋大为感慨，对危素说：南宋诸皇帝没有太过失德，又和元朝没有世仇，元朝趁其虚弱取而代之，对帝陵为何又如此残酷破坏？
宋理宗头骨经历八十多年的颠沛流离，在洪武二年（1369年）被安葬回原处，明太祖朱元璋同时诏令，重新修复了宋六陵。
