发展鼎盛之时，莲花集团开始在资本市场崭露头角。
1998年8月25日，莲花味精于上海证券交易所上市，股票发行价格为7.01元/股。截至1998年年底，莲花集团为莲花味精的控股股东，持股比例约为67%。
顶着"味精第一股"的光环，莲花味精在上市最初的10年里表现相对平稳，仅在2003年净利亏损约1.45亿元。
彼时，莲花味精表示，2003年，公司面临上市以来最大的困难。2001年和2002年的原料替代试运营成功给2003年做好了准备，公司乐观地预计2003年主营业务收入同比将增加15%以上，但是，突如其来的"非典疫情"给公司良好的生产经营造成一定的困难。此外，由于全国小麦和玉米大幅度减产，2003年下半年，特别是第四季度，小麦价格涨幅较大，而味精市场价格由于市场的激烈竞争不涨反降，造成公司2003年出现亏损。
转折点发生在2009年。这一年，莲花集团失去了对莲花味精的控制权。
根据莲花味精2009年年度报告，莲花集团将其持有的上市公司限售流通股600万股转让给中国东方资产管理公司,以抵偿莲花集团对中国东方资产管理公司所负债务11957.75万元。
此外，因莲花集团与浮梁莲花金水彩印有限公司债务纠纷，景德镇市中级人民法院于2009年6月委托上海公益拍卖有限公司拍卖莲花集团持有的上市公司225万股限售流通股。因莲花集团与中国进出口银行债务纠纷，北京市第二中级人民法院委托北京中招国际拍卖有限公司拍卖莲花集团持有的上市公司1750万股限售流通股。莲花集团与河南省农业综合开发公司债务纠纷，莲花集团以所持有的上市公司股份5400万股限售流通股抵偿给债权人河南省农业综合开发公司，该股权已于2009年12月11日过户给河南省农业综合开发公司。
