侯君集派遣使者招降麹文泰之子麹智盛，但麹智盛拒绝投降。于是侯君集召集工匠制造抛石车，向城内投掷石块。高昌城内石如雨下，士卒百姓被砸伤者不计其数。侯君集又下令士卒用大木撞塌城墙，攻入城内，包围高昌皇宫，高昌王麹智盛无奈投降。
侯君集拿下高昌后，缴获了许多珍宝。看到堆积如山的国宝，侯君集的老毛病又犯了。他居然没有将财宝登记造册，悉数上交，而是偷偷地据为己有，并且纵容手下士卒强抢百姓财物。
李世民知道后，将侯君集逮捕下狱，后念及他的功劳，以功抵过，开罪释放。
侯君集认为自己是国家功臣，仅仅因贪财而招致牢狱之灾，心中对李世民颇有怨恨。
恰逢其时，张亮被贬往洛阳做都督，侯君集和他大有同病相怜之感。于是，侯君集撺掇张亮造反，对张亮说："李世民如此对待功臣，不如我们一起反了吧。"张亮不从，将侯君集的话上奏李世民，李世民又一次宽恕了侯君集，不但没有问罪，反而一如既往地善待于他。
