但曾国藩和曾国荃两兄弟打下金陵，搜遍了洪秀全的宫殿，却发现别说大宝藏了，就连一个普通的金库都找不到。于是奏称："历年以来，中外纷传，逆贼之富，金银如海，乃克复老巢，而全无货财，实出预计之外。"清廷想用洪秀全财宝充实国库的愿望落了空。
有一种传言，说曾国荃攻克金陵城后，大发国难财，把洪秀全的财宝都装进了自己腰包。不管真相是曾家兄弟监守自盗，还是确实没有宝藏，他们都绝不能让李秀成到北京招供。万一李秀成一口咬定，城中本来有财宝，现在却不翼而飞，朝廷细究之下，曾国藩兄弟便是杀头的大罪。
所以，曾国藩不惜抗旨不尊，烧掉洪秀全尸身，又擅自将李秀成和洪仁达二人处决，是为了自己保命。而对这两件事，曾国藩都说是为了防止沿途骚扰地方，用同一条理由敷衍了过去。
一方面死无对证，另一方面曾国藩又大权在握，清廷也不敢贸然追究曾国藩的抗旨之罪。最后，曾国藩不仅没有受责，反而被大大表扬了一番。
清廷下谕旨说："曾国藩奏、各将士于六月二十七日，在伪宫内掘出洪秀泉逆尸，经该大臣等验毕戮尸焚毁。该逆虽逃显戮于生前，难免极刑于身后，亦足以大快人心。""将该二逆极刑处死，免致沿途骚扰地方，所办甚是。"一场大祸，便这样消弭于无形了。
