1360年，在多方邀请下，刘基来到应天，准备投奔朱元璋。骂义军为贼的这段对话，正是这个时候发生的。刘基一下子点出了义军的致命弱点，“九恶”是指没有目标、不懂兵法、不爱百姓、相互火并等等，不改掉这些毛病，义军不可能得天下。
朱元璋对九恶是深有体会，他从郭子兴帐下的小卒干起，刚刚显示出能力，积攒起一些实力，便受到郭子兴的猜忌，差点把命送在自己人手里。至于各路红巾军之间的攻杀、背叛，更是数不胜数。
朱元璋不愧是能成就帝业的绝世豪杰，不但没有怪罪刘基，反而着力革除这些弱点，把自己打造成各路义军中最有战斗力，最受百姓欢迎的势力。纵观中华数千年历史，真正由农民起义，而最终成就一方帝业的，也仅此一人而已。
除了九恶论，刘基还给朱元璋献上了《时务十八策》，给朱元璋指明了先南后北、先陈后张的统一方针，这是堪比《隆中对》的战略指导书。朱元璋后来的作战行动，完全按照十八策的谋划，取得了最后的胜利。
刘基辅佐朱元璋八年，就像张良辅佐刘邦那样，出谋划策，运筹帷幄，将陈友谅、张士诚一一打败。1368年，朱元璋称帝，建立明朝。经过这么多年的积累和历练，朱元璋的实力远远超过了元朝。不足一年便收复大都，终结了元朝的统治。
刘基擅长观天象，并常常以此来劝诫朱元璋行仁政，少施死刑。他制订很多法令，为民间处理积久案件，平反了不少冤案。因此，民间传说刘基能掐会算，通天晓地，有活神仙的美名。
