由于李靖告密事发，被李渊虏于帐下，并打算将李靖处死。
李靖心灰意冷，觉得自己的生平抱负无法施展，有感而发："公起义兵，本为天下除暴乱，不欲就大事，而以私怨斩壮士乎!"李渊听完这番话后，觉得李靖的确是个人才，加上李世民从旁求情，李靖终免于一死，成为李世民的副将。公元620年，割据荆襄的萧铣与李唐爆发战争，为了解决萧铣的南梁政权，李渊调李靖前往夔州。
李靖在前往夔州的过程中，遭遇了邓世洛率领的几万名蛮人。随即，李靖与庐江王联手击溃了蛮兵，但却因此延误了前往夔州的时机。李靖来到峡州后，因手中人马不足，所以采取据守不出的战略，成功瓦解了萧铣的进攻。然而，远在长安的李渊却认为李靖没有及时前往夔州，逗留不进延误战机，命令峡州都督许绍将李靖处死。
峡州都督许绍深明大义，他认为：李靖是不可多得的人才，杀之可惜，一再为李靖求情，这才使李渊收回成命。过了一段时间，李靖将功赎罪，取得一场大胜。开州蛮族首领冉肇则兴兵作乱，赵郡王李孝恭多次讨伐无果，李靖仅率八百死士偷袭冉肇则的营寨，又将主力埋伏在险要峡谷中，一举击杀冉肇则，并俘虏蛮兵五千余人。
