第二年，天下遭遇水旱灾害，建文帝很忧虑，他下诏，要求官员们指出朝廷以往施政的得失。礼部尚书陈迪建议"清刑狱，恤流民"，这反映出朱元璋时期不仅刑狱严峻，而且对流民很冷酷。他还指出了朱元璋用人的弊病，"太祖皇帝时用人，狥其名而不求其实，以小善而遽进之，以小过而遽退之"。意为只求虚名而不务实际，有一点小的功劳就提拔，又因为一点小的过失就罢斥，这与朱元璋在人们心目中那种求真务实，体恤百姓的印象大相径庭，可是建文帝却"深采纳之"。他完全肯定了这种对他爷爷的评价，如果《建文皇帝遗迹》的记载属实，那么真实的朱元璋与其在史书中的形象就有很大差别了。
《建文皇帝遗迹》中记还载了一件很有意思的事："建文三年庚辰春三月，廷试进士，赐王艮状元及第。将传胪，以貌不及胡广，遂以广易之，艮次焉。"是说在建文三年的殿试中，本来以考试成绩确定王艮是状元，正要公布时，却因为他相貌不如胡广而改授榜眼，胡广则当了状元。虽然古今都看重颜值，但是从这件事来看，古代关注颜值的程度显然比现在高得多。
建文三年五月，户科给事中陈继之上疏，抨击江南的寺院道观大量侵占百姓的良田，他请求朝廷颁布规定，每个僧人或道士只能拥有五亩土地，其余的分给百姓，建文帝表示同意。
土地兼并是历代封建王朝的痼疾，也是改朝换代的的动因，从陈继之上疏可以发现，在明初，土地兼并现象已经很严重了。
