不过到了太平运动的后期，各首领之间争权夺势，生活奢侈。傅善祥当差的东王府也是及其奢靡，美女收罗了无数。东王杨秀清更是把傅善祥占为己有。后来随着矛盾的升级，杨秀清更是想要取代洪秀全，傅善祥却站出来反对，指出应以大局为重，却遭到杨秀清的斥责。后来，太平天国天京事变，傅善祥就一直下落不明，有些人说傅善祥被乱军砍杀后抛入大江，也有人说她与何震川逃了出去，双双隐居在上海的小里弄里，不为人知。那么傅善祥到底流落何方，却成了一个历史之谜。
不管怎么样， 傅善祥作为中国历史上第一个也是唯一一个的女状元，她的才华和见识那都是大家所认可的。虽然最终没有改变自己的悲惨命运，但是她为那个时代解放妇女所做的贡献，大家也是有目共睹的。
