(清军长时期龟缩在保宁一带)
永历朝廷设立的各路军阀却不能团结,反而展开自相残杀,驻守重庆的袁韬设计杀死驻守嘉定的杨展,"二三年来,操戈同室"[6],再加上天灾不断,粮食紧缺,给人民造成很大灾难,吴三桂趁机进兵,控制了四川的大片土地。此时,退往云贵的大西军余部在孙可望的领导下势力强大,永历皇帝退入孙可望的势力范围,孙趁机发动北伐,令刘文秀统帅大军进入四川,他所统帅的由大西军改编的明军同其他军阀不同,战斗力极强,且受到人民欢迎,吴三桂被迫退往保宁。顺治九年十月,明清双方在保宁展开大战,刘文秀由于过分轻敌,最终被击败。但是,清军损失也十分巨大,吴三桂部不得不退守汉中,根据此时李国英的奏报,连成都府都尚未在清军控制之下,更不用谈四川其他地区。
清军退守陕西的另外一个重要原因是,顺治九年,李定国在桂林和衡阳连续击败清恭顺王孔有德部和敬谨亲王尼堪部,清军在主战场遭到严重挫败,包括八旗满洲精锐在内的大量部队损失,
在全国战场被迫收缩兵力,处于守势。