鲁王朱以海出自明太祖朱元第十子鲁王朱檀一脉，也比崇祯帝大几个辈分。弘光帝被俘后张国维、张煌言、钱肃乐等人在绍兴拥立他为监国，鲁王政权与在福建的隆武政权相互排挤，并不一致对外。隆武二年清军攻占浙东，鲁王流亡海外。永历五年入据舟山，永历七年清军攻陷舟山，于是鲁王在张名振和张煌言的陪同下取消了监国的名义，赴厦门投靠了郑成功。但是郑成功不满朱以海之前大敌当前还与隆武帝相互争斗，于是在朱以海想要重返南澳岛发展力量时将他沉杀于海中，也有说鲁王是病死的。
南明永历帝：桂王—朱由榔
永历帝朱由榔是桂端王朱常瀛之子，朱常洵与崇祯帝之父朱常洛是亲兄弟，所以永历帝与崇祯帝是堂兄弟的关系。隆武二年朱由榔袭封桂王的爵位，在广东肇庆称监国，隆武政权败亡后登基称帝，次年改元永历，永历帝也是南明最后一位皇帝了。朱由榔依靠着大西残部李定国、孙可望等人在西南一带顽抗的抵挡着清朝，虽然抵御时间较长，但是也阻止不了历史前进的脚步。永历十五年清军攻入云南，朱由榔逃到缅甸被缅甸国王收留，但是后来吴三桂攻入了缅甸逼迫缅王交出永历帝，当时的缅甸国王哇达姆摩刚刚弑兄自立，国内政权不稳，根本无法与吴三桂和大清作对，只能答应交出永历帝。吴三桂把永历帝押回云南后担心如果押到北京路途遥远，一定会有反清人士解救永历帝，于是在清朝的同意下在昆明就将永历帝绞死了。
