司马德文虽然小心谨慎，怕刘裕起杀心，但刘裕还就是起了杀心，他不仅将司马德文皇后刚生下来的儿子杀死，还派人毒杀司马德文，结果第一个杀手不忍心下手，反而自己喝毒酒死了。刘裕暴怒，又派了一个杀手去刺杀。而司马德文说，自杀的人是不能投胎为人的，拒绝自杀，被杀手用被子活活捂死。
刘裕也是个狠人，之前觉得怕自己一世忠臣的英明毁于一旦，不敢下手，既然"弑君"的罪名已经坐实了，他的骂名也背定了，那多死一个少死一个又有什么关系？于是他将司马皇族屠杀得一个不剩。
再者刘裕这个人阴毒城府深，经过刺杀失败一事他心中有阴影，认为不少人仍然心里有旧主，如果司马一氏不死，他就一天不得安宁。最重要的原因是，他的儿子刘义符只有17岁，未经历练，只是纨绔子弟，刘裕担心这些旧人会威胁到儿子的帝位。不狠心，也做不了帝王。
刘裕称帝后，改元永初，史称刘宋，从此中国进入了南朝与北魏对峙的历史时期。
