按照正常情况，阿云几乎算是死定了。可这时候，许遵由登州知府升为大理寺卿，有足够的权限来过问阿云的案子了。他据理力争："刑部定议非直，云合免所因之罪。今弃敕不用，但引断例，一切按而杀之，塞其自守之路，殆非罪疑惟轻之义。"在许遵看来，刑部不分青红皂白判处死刑，是违背了罪行轻重有可疑之处、只应从轻判处的原则。
御史台的谏官闻讯，随即弹劾许遵妄法。许遵不服气，请求朝廷将案子交给翰林学士们进行讨论。于是，这件事惊动了宋神宗。宋神宗了解到案子的前因后果后，交给翰林学士王安石和司马光来讨论。
众所周知，王安石和司马光都是一代名臣，却因为政见不同，成为相互攻击的政敌。他们虽然都是翰林学士，却在阿云的案子上又出现了分歧。
简而言之，王安石支持许遵的意见，建议对阿云从轻发落；司马光支持刑部的意见，建议对阿云判处死刑。争论的焦点是，阿云到底算不算自首。如果算自首，就不能判死刑；如果不算自首，她就死定了。
王安石、许遵等人的依据，来自于宋神宗的诏令；司马光、刑部等人的依据，来自于《宋刑统》"於人有损伤，不在自首之例"条文。他们公说公有理婆说婆有理，谁也说服不了谁。
