从整体上看，巴塔的组织架构更加自主和扁平化。在遇到头目死亡或类似事件后，巴塔内部会发生较大组织结构调整，新的派别得势后会开始一系列有利于自己的调整，但这样松散的结构导致各方势力有较强的生存能力、能根据自身利益需求开展行动。
双方的合作与冲突
在巴塔成立之初，由于有美国这一相同的敌人，因此巴塔和阿塔曾有过短时间的合作。但正如上文所介绍的，阿塔和巴塔在政治诉求和斗争手段等方面存在巨大的分歧，双方的关系开始恶化。实力壮大的巴塔开始频繁袭击巴基斯坦官方目标，在巴基斯坦各地实施恐怖活动，手段及其残忍，这对于阿塔试图对外塑造的“塔利班”形象严重不符。2009年，阿富汗塔利班发言人接受《纽约时报》采访时说，“我们否认和巴塔有任何关联。”2014年，巴基斯坦白沙瓦的一所军方学校遭到6名巴塔恐怖分子血洗，造成132名学生在内的149人死亡，震惊了世界，阿富汗塔利班也对此表示谴责。在军事层面上，巴塔和阿塔也多次发生冲突。
白沙瓦学校遇袭事件中的无辜受害者 图源：社交媒体
近年来，巴塔正在向国际化进行发展，大量收拢国际恐怖组织，并与当地的其他极端组织关系密切，南亚恐怖组织网络大多与巴塔有着紧密的资金往来。而在人员的招募和培训上也和巴塔有着频繁的合作。在实施恐怖袭击的过程中，巴塔时常会参与其中并提供帮助。在遭遇到国际社会的军事打击时，巴塔也会利用其地理位置的复杂性，为其他极端组织头目提供保护。前“基地”组织头目本拉登就是在巴基斯坦塔利班的协助下，躲避了美国十多年间的数次追捕。
巴塔同境内外极端组织的紧密联动，使得该组织具有很强的“国际性”。2014年，巴塔的6名领导人一度曾宣誓效忠极端组织“伊斯兰国”的领袖巴格达迪，后因为双方关系恶化而不了了之。该组织不仅在国际范围内大肆招募极端分子，也能从境内外获得其他组织的资金和装备支持。因此，巴塔已经不仅仅是一个地区性的恐怖组织，它对于国际安全局势产生了极大的威胁。
