至于天京事变，其实真正的幕后黑手乃是天王洪秀全。作为太平天国的精神领袖，从前期将军政大权放心交予杨秀清打理，到定都后对杨秀清借"天父附体"干涉皇权，甚至差点真正被当众仗责，洪秀全是怀恨在心的。不过洪秀全不便直接对杨秀清下手，于是就借"棋子"北王韦昌辉之手。反观杨秀清，虽专横跋扈，但确无造反的动机和理由，因为"天父附体"还得靠洪秀全以天王、天子身份的全力配合，才能服众。如果洪秀全被废，太平天国的理论体系就会破产，杨秀清对此是非常清楚的。天京事变期间，如果杨秀清早有篡位之心的话，他事先会先把韦昌辉天京"卫戍司令"的职位给免了，换上自己的心腹。同时，杨秀清作为身经百战之人，在如此重要的节骨眼上，所有军队的调动和安排都会在其严密掌控中，哪容得到韦昌辉调动大军一无所知。直至事变时，东王直属的几万部下连像样的反抗都没有，就被团灭，这哪里像是即将篡位之人的布局。
洪秀全通过天京事变，实现了从幕后走到了台前的夙愿，也将太平天国的所有权力重新牢牢抓到了自己的手里。但是太平天国没有了杨秀清，军事上再也没有出现过初期的辉煌，随着韦昌辉被诛，石达开出走，天国初建时的高层精英损失殆尽，太平天国也奏响了覆灭的预曲。
