按照拜上帝教的规定，凡是拜上帝者皆为天父子女，不拜上帝者为妖徒鬼卒，均在斩杀之列。这样以顺逆、人妖来划分敌我，又严重地扩大了打击面。同样，狭隘的宗教信条还使太平军失去了很多的盟友和同盟军。如上海小刀会起义之后，首领刘丽川等极欲归附太平天国，上书洪秀全愿受驱使，但天国始终未派兵接应，任其孤立无援，终至败亡。其他如福建的小刀会、红钱会，江西的边钱会，广西的升平天国、大成国，包括淮河两岸的捻军等各地各民族起义。
反观同样是打着宗教旗号（明教）的朱元璋，在有了自己的军队和地盘后，就淡化宗教色彩，与淮西知识分子阶层合流，建立了符合中国当时实际的地主政权，最终统一天下，也是农民起事唯一成功者。
所以关于太平军的战略选择，不论定都南京也好，乘势北伐也罢，其实都不是成败的关键。毕竟根本有问题，再如何发展也没用。
