不过，王莉仅出任贵州茅台副总经理一职不到2年。2017年2月，包括王莉在内5名茅台高管辞职，王莉辞去公司董事、副总经理、总工程师和董事会战略委员会、风险管理委员会委员职务。彼时亦传出袁仁国退休的传闻，频繁的人事变动，令外界产生联想。
在辞去上市公司相应职务后不久，2017年10月，茅台集团启动新一轮全面质量提升计划，任命以王莉为首的7名首席质量官，此举在白酒行业尚属首次。
王莉也是国务院特殊津贴专家，曾获得国家技术发明二等奖、国家酿造高级评酒师、全国首批轻工"大国工匠"等荣誉称号，还以其名字命名了国家级技能大师工作室--"王莉技能大师工作室"。
在李保芳和高卫东时代，茅台内部"换血"不断，而王莉依旧担任茅台集团总工程师和首席质量官的职位。在茅台集团新班子9名高层中，仅有王莉和茅台集团副总经理杨代勇和茅台集团副总经理万波是"老茅台人"，其余6位皆是来自茅台外部的"空降派"。
"白酒院士"渊源
茅台与院士颇有渊源。
早在2018年8月，茅台集团挂牌成立院士工作站，由我国发酵工程和环境微生物研究领域专家、中国工程院院士、原江南大学校长陈坚领衔，挂牌仪式由王莉主持。这是酱香白酒行业首个院士工作站，也是茅台集团与江南大学战略框架合作协议中的一项重要内容。
陈坚表示，院士工作站将聚焦茅台酿造微生物研究、固态发酵过程调控、茅台智慧制酒厂房建设、白酒品质研究技术保障、食品安全控制等领域，着力以关键共性技术、前沿引领技术、现代工程技术、颠覆性技术创新为突破口，引领全球酿酒技术和固态发酵技术发展。
2020年11月26日，茅台集团与中国科学院大连化学物理研究所在大连签署战略合作协议。茅台集团与大连化物所决定共建"贵州茅台集团--大连化物所现代分析检测协同创新中心"。
中国工程院院士、中国科学院大连化学物理研究所所长刘中民表示，希望双方以此次战略合作协议签署为契机，充分发挥大连化物所在分析、检测、先进装备研制等方面的技术优势，围绕茅台酒全产业链的质量控制体系流程，深入开展技术、人才、平台等领域合作，进一步提升茅台酒质量和管控。
实际上，白酒企业建立院士工作站并非新鲜事。近年来，古井贡酒（000596.SZ）、泸州老窖（000568.SZ）、山西汾酒（600809.SH）和五粮液（000858.SZ）等白酒企业也相继建立院士工作站，但白酒企业内部均无院士。
此次王莉若能成功入选中国工程院院士，则将填补这一空白，而王莉此番获得推荐早有迹象。
2020年11月末，贵州省公布第9批省管专家建议人选名单，王莉名列其中。2021年2月4日，根据贵州省人才工作领导小组统一部署，王莉获颁"贵州省省级高层次人才服务绿卡"(又称"优才卡")。据悉，"优才卡"是贵州省人才工作领导小组根据《贵州省"优才卡"制度实施办法(试行)》设立，首批发放对象主要是"两院"院士、国家级人才计划项目入选者或有关奖项获得者、贵州省核心专家。
