此后慕容超长期被刘裕困在城内，丝毫不敢出城迎敌，最终南燕尚书悦寿开城门投降，刘裕带兵入城，杀光了南燕鲜卑族的皇族多达三千多人，而慕容超本人也被带去南京斩首。
巴蜀政权在西部川地，是地理位置比较偏僻的政权。也正是因为如此，谯纵才会在这里称王称霸。进攻巴蜀有两条路可以走，一条内水，一条外水。上次刘敬宣进攻巴蜀的时候，是从内水走的，所以蜀帝谯纵认为刘裕这次一定假装从外水进攻，其实为了掩人耳目，依旧把主力放在内水。而刘裕却偏偏反其道而为之，他把主力布置在外水，而佯攻部队则赶往内水。这件事为防止泄密，直到出兵后到了白帝城时，刘裕才命人宣布了这件事。结果谯纵果然是把主力大军安排在内水，结果刘裕大军从外水进入，成功灭亡谯蜀政权。而谯纵则选择了上吊自杀，算是被刘裕给逼死了。
03灭后秦，刘裕杀姚泓，真正实现了光复洛阳长安两都。
刘裕在南方的战事非常顺利，解决完南方事务以后，刘裕便打起了北伐的念头。之前灭亡南燕算是小试牛刀，这次他要面对的对手，是后秦。
