出家禅隐说
李自成殉难九龙山的史料中存在疑点，才有了出家为僧的说法。二百多年前，乾隆年间湖南澧州知州何磷认为所谓李自成窜死九宫山之说，实际上是李自成"设疑代毙"来作为脱身之计。他还通过实地考察，咨询故老，确信灵泉寺祖师"奉天玉"大和尚就是当年的李自成。民国初年，国学大师章太炎在夹山海访得李自成《梅花百韵》诗五首，并以此证实李自成归隐灵泉寺的这一事实。
在1981年，湖南石门夹山寺发现一座古墓，考古人员发现墓主人奉天玉和尚违背僧规，按俗礼下葬，而葬俗又与本地葬俗不同，通过古墓出土印有帝王专用的麒麟和凤凰瓷罐、陕北特有的陪葬品福禄砖、"奉天玉诏"的铜牌等种种物证认为奉天玉和尚很可能便是李自成。但是李自成的陕西口音、独眼这些特征很容易暴露而被清军发现，因此李自成出家之说也有疑点。
青城老家归隐说
