连续两月的攻防战，使双方体力都接近枯竭。蒙古大军仗着人多势众，本欲一鼓作气拿下城池，不料天公不作美。4月3日起，合州地区连降暴雨20天，蒙军不得不暂缓进攻，这也为钓鱼城守军赢得宝贵的喘息时间。
4月22日，大雨初停，蒙军都总帅汪德臣率部发动夜袭，再次被击退。5月初，合州天气转暖，初夏晴热的气候引得蒙军大量不适，加上连连攻城不克，军士锐气大减。此时，王坚抓住敌方疲弱期，趁夜率数百勇士出城，实施了对蒙哥的"斩首行动"，幸得各部众人拼死护卫，王坚才未得手。
6月，吕文德舰率战舰千艘，军队二万余人，逆江而上，经过激战，冲攻在涪州的浮桥，进入被围困的重庆城。随后吕文德率舰队再沿嘉陵江北上，援救钓鱼城。史天泽利用蒙军占据上游的有利条件，在钓鱼城南的三槽山黑石峡顺流攻击吕文德军，吕文德被击败后只得退守重庆。
钓鱼城防御体系示意图
