1126年，金国大军南侵，一路攻城略地，很快便打到了汴京城下，不久城破，太上皇宋徽宗，皇帝宋钦宗，还有一众皇室成员，朝中大臣全部被俘，当时，秦桧也是俘虏之一，继而全部被押往北方。万幸的是，当时的康王赵构并未在汴京，成为了唯一的漏网之鱼，之后便逃到了杭州，并在此建立了南宋，登基称帝，史称宋高宗。
一众宋朝大臣被押到北方后，个个忠贞不屈，唯独秦桧一人屈服于威逼利诱之下，见风使舵，成为了粘罕的膝下之犬，赐给了他钱万贯，绢万匹。1130年，在宋高宗的卑躬屈膝之下，部分的朝臣被放了回来，其中便有秦桧，而回到故国的秦桧，似乎变了个人似的，他的所作所为，似有"身在曹营心在汉"之感。
秦桧一回到临安，便受到了赵构的赏识，先是将其擢生为参知政事，随后又晋封为"一人之下万人之上"的宰相之尊。作为主和派的顶梁柱，秦桧奉行的是"割地、称臣、纳贡"政策，而对抗金的将士一直都是极力的打击和贬斥，特别是素有抗金名将之称的岳飞和他的岳家军，更成为了秦桧的眼中钉、肉中刺，欲拔除而后快。后来，更是以"莫须有"的罪名，将岳飞杀害于风波亭。
而作为皇帝的赵构，为了自己的私欲，为了皇位着想，愣是对抗金之举表现消极，同时也大力的压制抗金力量，而秦桧成了他的急先锋。因此，秦桧在任期间，深受赵构的宠幸，君臣二人似有一种"一丘之貉"之感。在1138年，秦桧更是被赵构封为了魏国公的爵位。
