驻藏大臣图
清初对苗族以及其他少数民族的统治仍然沿袭元、明时期的土司制度。其实这是中央政府对西南地区的一种妥协退让的政策。在这种政策之下西南地区的少数民族首领担任当地的土官。而且他们的官职是世袭的，基本上都是父死子继。这一制度在实行之初对于建立统一的大一统王朝有很大的积极作用。但是后期这种政策的弊端逐渐暴露出来，逐渐成为威胁中央集权的一种隐患。所以从明朝开始中央政府就开始实行改土归流。
"查云南土官多半强豪，所属苗民悉听其指使，残暴横肆，无所不为。其土官懦弱者，凶恶把目，为害尤甚，不但目无府州，亦并心无督抚。"――《恭谢圣恩，敬陈愚悃事》
《恭谢圣恩，敬陈愚悃事》
