237年，辽东的公孙渊在辽东自立为燕王，要搞分裂活动，魏明帝派别人去打了一下，结果失利，只得让司马懿这位老将出马。司马懿次年以太尉的身份征辽东，离开了与蜀军作战的主战场，历时约一年将辽东平定。
239年，正月里曹睿驾崩，司马懿还在从辽东回师的路上，他接到数道急诏，坐追锋车赶到洛阳，总算见到曹睿一面，曹睿向他托孤，让他与新任大将军曹爽一起共同辅佐年仅8年的少帝曹芳。
曹芳继位后司马懿仍任太尉，同时兼任侍中，持节、都督中外诸军、录尚书事，和曹爽各统精兵三千人，共执朝政，从此他没有再回西线战场，是否伐蜀也不由他一人决定。不久，曹爽一伙以少帝的名义升司马懿为太傅，其实是将其架空，司马懿虽位高、名高、功高，但其实逐渐淡出了曹魏核心层，后来司马懿索性称病不上朝了。
