但是朝廷里的东林党并不想看到皇上每天不理朝政，可是皇上和大臣中间有一个人挡着，这个人就是魏忠贤。魏忠贤刚掌握权力的时候还是想干一些实事的，于是他就把目光放在了朝廷中最有责任心、有能力的东林党人身上，想拉拢他们一起干一些大事。于是魏忠贤就亲自登门想结交东林党人，但是东林党这帮读书人非常傲气，眼界很高，瞧不起魏忠贤。魏忠贤就和东林党结下了梁子，开始疯狂的报复东林党。天启皇帝登基后,魏忠贤常常趁天启帝在专心制作木器时启奏，这时天启帝总是厌烦地说："朕知道了，你去照章办理就是了。"权力自然就落在了魏忠贤手里。
掌权之后的魏忠贤开始大肆打击东林党人，凡正直的大臣，都被以东林党的罪名惨遭横祸，东林党人被贬、被杀不计其数，其中最著名的当属杨涟、左光斗为首的东林六君子。当时朱由校已经快二十岁了，但还是没有明辨是非的能力，在他眼里魏忠贤就是帮他分忧的好人，东林党就是只会给他制造麻烦的坏人，魏忠贤就是利用这一点把朱由校紧紧地拿捏在手里，大明江山也就这样一天天破败下去，最后朱由校的死也跟魏忠贤有关。
天启七年1627年，朱由校23岁，对于朝廷政事的管理有一点意识了，但是已经晚了。一是木匠活做的时间太长了，对于朝政大事都不了解了，二是他的人生也走向了终点，23岁就死了。这天北京城风和日丽，魏忠贤陪着朱由校游湖，朱由校觉得坐大船不过瘾，就叫人弄了一艘小船，皇上刚坐上小船，湖面突然刮来一阵风把小船吹翻了，朱由校就掉水里了。随从的人见皇上掉水里了，赶紧下去把皇上捞上来了。可是皇上被捞起来以后，被风一吹，再加上本来身体就弱,于是就染病不起，最后就死了。
