元代设置了一个庞大的宿卫亲军组织加强对京畿地区的护卫。"诸国人之勇悍者聚为进军宿卫。"宿卫军主要有：隆镇卫、西域卫、唐兀卫、贵赤卫、钦察卫、阿速卫、斡罗思卫等，大多戍守在两都之间的交通干道附近，肩负保护都城北大门的任务。其中阿速卫驻守在古北口旁的潮河川，贵赤卫屯驻在檀州，钦察卫则常年在上都路及其附近屯驻。
两都之战爆发后，燕铁木儿弟撒敦和其子唐其势带领钦察卫军返回大都，加强大都的防守。而贵赤卫、阿速卫和隆镇卫投奔大都，增加了大都方面的军事力量，同时削弱了上都的军事力量。
在地方上除了征调的五卫屯田兵外，大都方面还控制着驻守湖广的平阳和保定两万户军、也速迭儿的山东河北蒙古军都万户军、朵列图的河南淮北蒙古军都万户军、不花帖木儿的东路蒙古军等多支蒙古镇戍军。
