1491年开始，帕竹政权一直不稳定，当时他们的首领是阿旺·纳姆伽尔。阿旺·纳姆伽尔在关键时候带着帕竹人派遣了信徒去不丹，阿旺·纳姆伽尔这个人显然是宗教合一典型，由于他的特殊身份，所以去了不丹之后人们都归顺于他。人们信奉阿旺·纳姆伽尔是因为他的护甲是四角神龙，四角神龙在不丹被看做是雷神。不丹的雷电多，其中的意味不可谓不重要。
1616年，他征服了不丹，并建立了政权。1669年，不丹跟西藏地区的政权爆发了战争，这一战持续了62年之久。他们自己其实也有陷入过内乱，1651年开始就有断断续续的，1729年彻底爆发。清朝原本没打算插手，但情况变成这样，他们不得不管。1730年开始，清政府派遣了西藏地区的官员颇罗鼐去调停不丹的内乱。
在颇罗鼐的调解下，不丹的内乱很快停止了。他们的第十任国王是米旁旺布，1736年以后他接受了清朝的册封。不过清末年间的时候，清政府的实力已经衰弱，所以当1772年，不丹受到英国入侵的时候，清政府无能为力。
