蒙古军随即攻占灵州，这里耶律楚材再次显示了过人的远见。入城之后，其他蒙军将领都忙于争夺子女玉帛，唯独他收取了府库中的文书档案与大黄等药材，不久，军队里流行病疫，耶律楚材便用大黄救治了上万将士。知道西夏投降只是时间问题的成吉思汗本人没有亲往中兴，而是留阿术鲁率军去围守，自领大军转攻金朝，在十二月移驻于盐州川策划明年的行动，并于此处接见了耶律留哥的遗孀姚里氏，同意让耶律留哥长子耶律薛阇（曾于1218年蒙古与花剌子模的遭遇战中救过术赤）袭爵。成吉思汗深知西夏的军队在战败后会以最快的速度集结，并擅长利用各种地理屏障牵制、对抗敌人，因此除在贺兰山地区与阿沙敢不厮杀之外，只是沿着西夏边境行军，目的在于吸引敌军主力布防易守难攻的贺兰山一线，取得声东击西的效应，以减轻蒙古西路军进攻的阻力。
西路军：速不台率军于三月越过西夏边境，进入额济纳河地区。李德旺命人毁坏渡河的桥梁。尽管如此，当速不台和蒙古军先锋抵达此地后，仅用一夜时间即修好渡桥，向黑水城（此处的黑水城应指黑水镇燕军司）挺进，并在该城附近击败了一支由撒里畏兀儿、特勒和赤闵部组成的联军。随后黑水城因切断后路而请降，蒙古军占领该城。
五月，蒙古军围肃州。肃州守将是蒙古千户昔里钤部之兄。他射书到城外商讨投降事宜，结果事情泄露，全家被杀。肃州城坚，久攻不下，蒙古遣昔里钤部前去谕降，城内将士不听，待城被攻破，蒙古军屠城，但在昔里钤部的请求下保下了一百零六户百姓的性命。
