锦衣卫的长官为指挥使，是为正三品，副长官为指挥同知，是为从三品，其下还有指挥佥事，是为正四品，镇抚使从四品，紧接着便是分别属于正五品、从五品的千户与副千户，以及属于正六品与从六品的百户与试百户，最后是正七品与从七品的总旗与小旗。
六扇门是三法司衙门的合称
明朝时期，三法司指刑部、都察院和大理寺三大衙门。刑部负责案件的审理；都察院负责审案过程的监督与纠正；而大理寺则对所有案件进行审核，发现问题，可以驳回，要求刑部重新审理。
凡是遇到重大案件，都要进行三法司会审。之所以由三大衙门一起审理，就是为了避免出现冤案、错案。当然，古人常说有钱能使鬼推磨，能不能真的做到公平、公正，不好说，但至少从制度上而言，相对合理。
