据《新唐书》记载："尝仵旨，当诛，后惜其才，止黥而不杀也。"关于上官婉儿为什么被黥面，史学家的说法也各有不同。
一种说法为嗣圣元年，武则天将当时的中宗废为庐陵王，自己当上了皇帝。当时的扬州司马徐敬业率众军讨伐武则天，骆宾王还写了一篇名为《为徐敬业讨武曌檄》的文章，婉儿因佩服骆宾王的才学，在与武则天交谈中，讲出了要爱护人才的话，招致女皇武则天的不满，后因爱惜其才华，遂下令对婉儿处以了黥刑；
还有一种是比较离谱的，说是上官婉儿被武则天的面首张昌宗吸引，二人关系暧昧，被武则天所知，婉儿被皇帝处以了黥刑。
