隋朝建立之后,巩固边防、南平陈朝是当务之急。高颎在平陈方面,他起了重大作用。开皇元年,文帝根据高颎的推荐,派贺若弻为吴州总管镇广陵,以韩虎为庐州总管镇庐江,要他们筹划平陈之事。第二年,以高为总指挥,发兵南征。兵出之后,陈宣帝死讯传到,高颎以“礼不伐丧”为理由停止进攻,班师回朝。通过这次试探性的攻击,高颗提出了一系列灭陈的方略:首先是优待俘虏,以瓦解陈军士气;二是实施麻痹战术,不断派兵在江边演习,陈军习以为常,定会大意;三是削弱陈朝国力,每到陈朝的收获季节,就出兵骚扰,并派人深入江南,放火焚烧陈朝储备。杨坚按照高题的设想去做,果然收到很理想的效果。
开皇九年(59年),杨坚派晋王杨广为总指挥,分三路大军大举进攻陈朝。而这时高颎是晋王府长史,掌握着实际的指挥权。他又经常派兵缘江狩猎,人马喧嚣,如此反复,也使江南陈军麻痹起来。结果贺若弼由广陵渡过长江,陈军还不知道。与此同时,另一支军队在韩擒虎的率领下也渡江到了采石。贺若弼渡江后俘虏陈军六千人,全部予以释放,发给粮食,并将隋朝诏书交给他们带着,要他们宣传隋朝伐陈的政策。结果,隋军所向无敌,纷纷降附。隋军迅速攻入建康,抓到了陈末帝陈叔宝,陈朝灭亡,隋朝大体统了全中国
高颎在平陈之役中功不可没,所以在一次宴会上,文帝说:“高平定了江南,虞庆则使突降服,可以说是功助卓著啊!“