当时已经退居二线的太上皇宋孝宗和太上皇后谢皇后听闻儿媳的丑闻，想规劝下儿媳收敛些。但是李凤娘竟然欺负自己的公婆，顶撞公公宋孝宗，还嘲讽婆婆谢氏不是宋光宗的生母。而且还在宋光宗面前挑拨他们父子关系，此时病笃的宋光宗竟然对父亲有所误解。宋光宗甚至发誓不再理会父亲宋孝宗。
等到宋孝宗病危的时候，满朝文武上表劝谏宋光宗去探视太上皇。但宋光宗在李凤娘的挑唆下，以自己身体不好为由，拒绝探视，宋孝宗在遗憾失望中去世。而且宋光宗竟然拒绝出席父亲宋孝宗的葬礼，宋光宗不孝的举动，和李凤娘擅专朝政，引起朝野不满。
朝臣们找到宋高宗的吴皇后，也是宋光宗的奶奶，在吴太皇太后的出面下，赵汝愚、韩侂胄拥立宋光宗和李凤娘的儿子，嘉王赵扩登基史称宋宁宗。虽然宋光宗不愿意接受这个事实，但没人愿意让这个疯子皇帝执政。而李凤娘还想垂帘听政，控制自己的儿子，结果那群权臣先下手为强，将李家人罢免。李凤娘在朝中无人，只能老实的跟宋光宗住在行宫之中，失去权力的李凤娘又恢复了人性，照顾宋光宗的起居生活。
1200年，有相士告诉李凤娘，今年你在劫难逃。于是李凤娘换上道袍，每天闭门不出，在经堂吃斋念佛。当年六月，李凤娘病死，时年五十六岁，谥慈懿太后。而南宋由宋孝宗开创的大好局面，被李凤娘和外戚们破坏的政局不稳，南宋开始从此走上下坡路。
