朱元璋称帝后，逐渐有些脱离了人民群众，同时对手下人的要求逐渐严苛起来，处罚起人手段也经常过重，而马皇后则经常提醒他，救下了很多无辜的人。每逢灾年，马皇后就率领宫中女官吃素，并且还告诫朱元璋要克制自己，将美食佳肴拿去犒赏贤才。她还请求朱元璋厚待太学生们的家属，让他们也能有所生活来源。胡惟庸案发后，无数人受连累，其中就包括皇子的老师宋濂。朱元璋执意要处理宋濂，马皇后劝道："老百姓家都要优待老师，何况是皇家呢？"朱元璋不听，马皇后在吃饭的时候便不吃肉，问道缘故，她说："我是在为宋师傅祈福呢。"朱元璋才觉得自己做的确实有些过分，便从轻发落了宋濂。
宋濂
朱元璋虽然娶了很多妾，但对马皇后却是最为依恋的。平时严肃的朱元璋也会在马皇后跟前说一些让人脸红的情话。元大都攻破后，众将将宝玉带回来作为战利品。马皇后说："元朝皇帝有这块玉却守不住，说明圣君自然有真正的宝贝。"朱元璋说："皇后你就是朕最大的宝贝！"马皇后（不知道有没有羞赧的笑笑）答道："陛下说的没毛病。可臣妾和陛下一起患难与共这么多年，一直担心在安逸和富贵中滋生祸患，陛下一定要与贤者一起治理天下啊！"朱元璋非常认可，让史官把这句话郑重记载了下来。
