当年七月，瘟疫从直隶传至北京，北京百姓称其为"疙瘩病。发病时，人的身上会突然出现一块隆起的肉，而且还会吐出如西瓜水一样的血液。
一旦出现鼠疫病症，这个人很可能会在一个时辰之内病死，最迟也是朝发夕死。也因此，很多人根本没有医治的机会，鼠疫的死亡率高达100％。
明朝灭亡的前几年，疫情的规模和危害再次加剧，尤其是在崇祯十六年（1643年）。
当时，在一段时期内，北京城中每天因瘟疫死亡的人数不下万人，以至于北京城的各大城门都被出城的棺材堵塞了去路。后来很多人家阖门死绝，尸体竟然多到无人收敛的境地。
