从1998年5月13日开始，暴乱的消息就弥漫了整个雅加达。
期间大量华人的住宅、店铺被烧毁。
有一个数据是：2479间商业建筑，1026间民房，1604间商店，384间私人办公室，65间银行，45间工厂，40间大型购物中心，13间市场和12间别墅。
在5月14日，印尼开始出现了进行组织的排华屠杀。
那些暴徒穿着军靴被军用卡车运送到华人区，他们高呼"宰了中国人，烧死他们，这些中国狗"，然后开始抢劫商店和市场，随后，他们开始把妇女集中起来进行集体轮奸，印尼警察到场之后，并没有阻止暴徒的行动。
据雅加达人权与妇女研究组织经整理后的报告显示，5月发生的骚乱中，1000多名华人被杀。印尼各地总共发生5000多起暴徒强奸或轮奸华裔妇女的惨案。其中，以雅加达每天发生的100多起最为严重。
现在的人们无法想象当时的惨状，这场屠杀几乎与当年日寇在南京大屠杀中的罪行一样：
许多华人男性"像杀鸡杀鸭一样"被斩首，人头还被高挂示众。
一些华人女性被强奸或者轮奸后，又被残杀。她们年龄上到55岁，下到9岁。一个年仅9岁的幼女被暴徒用刀割下阴部，惨死。
还有至少20名女性，被丢入大火中活活烧死。网上有张图片就是暴乱现场几个印尼暴徒抬着一名华人女孩往火堆里扔。
一些遭强奸杀害的女性尸体，还被拖到街上侮辱，甚至还丧心病狂的暴徒用木杆捅进阴部再从嘴里插出，抬着游行。
以雅加达西区为例，28层的高档住宅区--海洋之友大厦，被数百名持枪持刀暴徒围困。
下午大厦大门被冲破后，防盗门形同虚设，暴徒们逐层逐户闯进去，男的遭毒打，家里的女生统统被轮奸，甚至还逼着家里的男人观看。
