此时的弟子虽然不懂师傅的意思，但仍然照做，没想到一年后，无暇禅师的尸身不但没腐，反而面色如常，栩栩如生，只不过浑身呈现僵硬状态，是为肉身菩萨，同时无暇禅师的尸身还时常散发出金光，颇为奇怪。后来这件事还惊动了崇祯帝，他亲自御赐无暇禅师为“菩萨肉身”，自此以后，九华山佛地声名大振，来此修心的人越来越多，镇国寺的规模也逐渐扩大，时至今日，占地面积已达到10892平方米。
除了无暇禅师，九华山的寺庙还曾供奉了比丘尼仁义、明净和尚、慈明和尚、大兴和尚、普文法师、宽德禅师等高僧的肉身舍利，但可惜的是，因为战乱等因素影响，其中6座已经失踪，余下则被精心供奉起来，供后人祭拜。