据2022年12月海南省市场监督管理局发布的关于12批次 不合格食品情况的通告(2022年第30期)，其中，海口麦点九毛九餐饮管理有限公司万达广场分店生产使用的骨碟（加工日期：2022-07-14），大肠菌群项目检验结果为检出/50cm²，标准规定为不得检出。
据2023年2月福建省市场监督管理局发布的2023年第6期食品安全监督抽检信息通告，其中，南京九毛九餐饮管理有限公司厦门湖里万达分公司的1批次小饭碗（消毒日期为2022年11月24日），大肠菌群项目检验结果为检出/50cm²，标准规定为不得检出。
另1批次该公司的筷子（消毒日期为2022年11月24日），阴离子合成洗涤剂(以十二烷基苯磺酸钠计)检测值为0.016 mg/100cm²，标准规定为不得检出；大肠菌群项目检验结果为检出/50cm²，标准规定为不得检出。
上半年增收不增利
此外，从业绩状况上看，2024年上半年九毛九还出现了"增收不增利"。财报数据显示，九毛九2024年上半年实现营收30.64亿元，同比增加6.42%；归母净利润为0.72亿元，较2023年同期的2.22亿元下滑67.47%。
其中，太二品牌是九毛九的主要营收来源，占报告期内九毛九整体营收的比重超过七成，但太二品牌的翻座率、翻台率及顾客人均消费金额较2023年同期均有所下滑。
九毛九在财报中解释称，由于严峻的外部环境导致客流量减少，进而影响了翻座率、翻台率，而九毛九考虑到市场状况及行业竞争格局等内外部因素，调整菜单结构及菜品价格，导致了顾客人均消费下降。
