在《三国演义》中，韩馥首次出场就是十八路诸侯讨伐董卓之时。当时董卓帐下猛将华雄在联军帐前挑战，韩馥便举荐道："吾有上将潘凤，可斩华雄。"令他没想到的是，潘凤刚一露头，就被华雄给斩了。而董卓看到联军势大，便挟持汉献帝，驱赶洛阳百姓迁都长安。当时韩馥和袁绍打算迎立大司马刘虞为帝，并写信寻求袁术支持，但却被袁术给拒绝了。而刘虞本人也不甘为他们的傀儡，拒绝称帝，甚至打算逃入匈奴将自己隔绝起来。
初平二年，韩馥部将麴义反叛，韩馥带人镇压却惨遭失败。袁绍因为与韩馥交恶，所以开始支持麴义。当时袁绍的谋士逢纪对袁绍说："要干大事，没个基地是站不稳脚跟的。冀州兵强马壮，但韩馥才能却很平庸，可以约公孙瓒一同进攻冀州，赶跑韩馥。同时派人对韩馥进行威逼利诱，他必定会投降。"后来袁绍依计行事，让公孙瓒以"讨伐董卓"的名义暗中偷袭韩馥，同时又派他的外甥高干和部下荀谌去劝说韩馥投降。
这二人对韩馥说："公孙瓒趁得胜南来，且各郡都积极响应他。袁绍东来，意图难料，您觉得会是这两人的对手么?"韩馥说："那我该怎么办?"于是这二人从各个角度论证，让位给袁绍是最好的选择。当韩馥开始动摇时，他的另外一些部下却极力反对，表示："冀州虽小，但能披甲上阵的有百万人。粮食不算多，但也可以支撑十年。有何理由让给袁绍这样一个外来户呢?"但韩馥却铁了心要让位，连率精兵赶回的赵浮、程涣都没能阻止他。
袁绍得到荆州后，就封韩馥为奋武将军。但这奋武将军却是个虚职，既没有兵，也没有官署。当年被韩馥欺辱过的河内人朱汉，为了迎合袁绍的心意便率军包围了韩馥的宅园，并打断了韩馥大儿子的两条腿。袁绍虽然后来杀了朱汉，但韩馥还是不放心，请求离去。袁绍同意后，韩馥就投奔了陈留郡守张邈。结果韩馥前脚刚到，袁绍的使者后脚就跟来了。二人商议机密时窃窃私语，韩馥以为他们是要谋害自己，便躲进厕所用刮削简牍的小刀自杀了。他也可以说是三国时期死的最窝囊的诸侯了。
