这一公司成立的目的旨在使整个包括美洲西岸的加利福尼亚、夏威夷群岛、库页岛南部和黑龙江口在内的整个北太平洋地区牢牢掌握在俄国手中。清政府在库页岛上的统治其实是极其薄弱的。这其中最明显的一点是：清政府并未在岛上驻军，这也是日、俄两国能无视中方主权而频频在岛上采取行动的重要原因。1765年沙俄远征队入侵库页岛北部，对当地的赫哲人进行屠杀和驱逐。1789年俄国又入侵了库页岛南部，再次对当地居民展开屠杀和驱逐。
在这两次军事行动后俄国人在岛上建立起政厅、教堂、监狱、学校、军营、煤矿等建筑，而对这一切不要说反击了，事实上当时身在北京城中的乾隆皇帝对库页岛上发生的一切甚至压根都不知情，这更进一步印证了清政府对库页岛管理力度的薄弱。在此之后尽管就法理上而言：库页岛仍是中国领土，但事实上中国在岛上已不存在实际的管辖，库页岛进入到日、俄两国争夺的时期。事实上不要说与大陆隔海相望的库页岛了，甚至就连作为清王朝龙兴之地的东北腹地也处于封禁状态。
入关之初的清朝统治者还缺乏统治一个大国的自信，因此他们试图将东北作为自己万一无法维持在中原的统治之时的最后落脚处，为此他们严格禁止中原汉人移居东北，因此东北绝大部分地区在晚清大规模的闯关东浪潮到来之前基本属于无人区。沙俄趁机利用东北防务上的缺陷一步步向黑龙江流域渗透。1858年5月28日清政府和沙皇俄国签订《瑷珲条约》：割让黑龙江以北、外兴安岭以南的黑龙江将军辖区和吉林将军辖区约60万平方公里的领土。
