此外,随着卫所制度的崩溃。明朝将领开始大量采用家丁填补自身军力的不足。这些士兵虽然没有脱离军籍,但实际上已经变成边军将领的家仆私丁。其中蓄养家丁最多的当属辽东总兵李成梁,在其担任辽东总兵二十多年时间里,凭借家丁私兵这种类似职业军人的私人武装,取得了"师出必捷,威震绝域""成梁镇辽二十二年,先后奏大捷者十"的骄人战绩,并成为了明朝后期的主要军事力量。
最后,对于西南委任统治的土司采用征调土兵的方式,补充明朝军力不足的,一方面降低国家军费的支出,另一方面也起到了削弱西南土司军事实力的目的,同时增强了部分土司与国家并肩作战、休戚与共的国家意识。这其中最具有代表性的就有四川土司秦良玉带领的白杆军和壮族土司训练的狼兵。
通过募兵、私兵、土兵与原有卫所兵相结合的方式,明朝有效的将多种形式的兵制相结合,为万历三大征提供了坚实的军事基础。